Yükseköğretim Daire Başkanlığının görevleri şunlardır:

a) Yükseköğretime giriş sistemine ilişkin usul ve esasların belirlenmesinde ilgili birim, kurum ve kuruluşlarla iş birliği yapmak,

b) 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu ile Bakanlığa verilmiş olan görev ve sorumlulukları yerine getirmek,

c) Yükseköğretim Kurulu Başkanlığından gönderilen ihalelerden geçici yasaklama teklifleriyle ilgili iş ve işlemleri yürütmek,

ç) Devlet konservatuvarında sözleşmeli olarak çalıştırılan sanatçı öğretim elemanlarına teşvik ikramiyesi ödenmesine ilişkin iş ve işlemleri yürütmek,

d) Üniversitelerde görev yapan personelin bilimsel nitelikli toplantılara katılabilmesi ve katılım bedelinin ödenebilmesine dair üniversitelere yetki verilmesine yönelik iş ve işlemleri yürütmek,

e) Üniversitelerin kiraya verilecek taşınır ve taşınmaz mallarına, üniversitelerce ihtiyaç duyulan tesislerinin yapımına, üniversitelere taşıt alım-satımı için izin verilmesine, araçlara sivil plaka tahsis edilmesine ve kamu yararı kararı alınmasına yönelik iş ve işlemleri yürütmek,

f) Üniversite bünyesindeki devlet konservatuvarı okullarının açılma ve kapatılma iş ve işlemleri ile öğrencilerinin e-Okulla ilgili taleplerine yönelik iş ve işlemleri yürütmek,

g) Galatasaray Üniversitesi Rektörlüğünden gelen öğretmen ve yönetici atama tekliflerini değerlendirerek Personel Genel Müdürlüğüne göndermek,

ğ) Daire Başkanlığının görev alanına giren konularda istatistiki verileri tutmak ve güncellemek,

h) Görev alanıyla ilgili mevzuatın hazırlanması, güncellenmesi ve geliştirilmesi ile ilgili çalışmalar yapmak,

ı) Görev alanı kapsamındaki iş ve işlemlere yönelik açılan davalarla ilgili bilgi ve belgeleri Hukuk Hizmetleri Genel Müdürlüğüne göndermek,

i) Görev alanıyla ilgili konularda CİMER ve MEBİM yoluyla gelen başvurular ile soru önergelerine ilişkin bilgi ve belgeleri İzleme ve Değerlendirme Daire Başkanlığına göndermek,

j) Genel Müdür tarafından verilen diğer görevleri yapmak.